《湖北医学史稿》在编纂过程中，参考了湖北及有关省、地、县方志，经史子集，百家著述，中医药典籍，以及近现代出版的人物辞典和有关资料。
　　《湖北医学史稿》所录医学人物，以里籍属湖北者为主，亦旁及少量在湖北有医事活动的外地医家。时间上起东汉，下至清末。主要项目分医家姓名、字号、生卒年代、籍贯、生平经历、故址、墓葬、医事活动和著述。按行政区划及时间先后排列。凡生卒年代不详与里籍不可考者列入本章之末，以姓氏笔画为序。
　　《湖北医学史稿》收录医籍系本省医家及外地寓居湖北医家的著作，时间下限以著作年代为准，截止至清末。著录项目分书名、作者、刊刻出版年代、内容评介。按作者籍贯所属行政区划分及写作与出版年代排列。
　　《湖北医学史稿》收载湖北各地县出产的珍贵药材、地道药材及大宗药材，一般只载名录，有特点者则予以简要说明。
　　《湖北医学史稿》中地名、称谓名称等以当时年代为参考。
　　为了方便读者检阅，书末附有按笔画排列的人物、医籍索引。