《巴蜀珍稀医学文献汇刊》是《蜀藏》系列丛书之一。《汇刊》分医经、中医基础理论、伤寒金匮、诊法、针灸推拿、本草、方书、临证综合、温病、内科、伤科、女科、儿科、眼科、咽喉口齿、医案医话医论等类，共收录巴蜀中医名家撰著中医文献五十余种，如高嵩乔《医易意约》、李文武《伤寒汤头总本》、何文焕《脏腑六脉诊法》、赖佑人《脉诀集注》、周正超《医方汇录》、薛贞夫《医法贯通》、陈谋《医门总录》、孙耀东《明医细解》、胡忠阀《学医偶得录》、吴鹤龄《医书杂钞》等，绝大部分是巴蜀民间所藏珍稀钞稿本，具有重要的学术价值和文献价值，并与即将出版的《川派中医名家珍本汇刊》等共同构成巴蜀中医文献体系。