黑格尔把整个自然界的发展看作是精神自我异化和自身复归的过程。本书分为四个部分，个部分导论，把自然界规定为一个由理念产生的、辩证发展的体系。篇“数学”考察的是空间和时间；第二篇“物理学”分为“力学”和“无机物理学”，前者考察的是排斥和吸引的统一，物质和运动的统一以及天体运动，后者考察的是光、颇色、磁、电和化学过程；第三篇“有机物理学”考察的是地质过程、植物自然界和动物自然界。自然界的整个发展过程都被黑格尔解释为“自然理念扬弃自身，变为精神的过程”。力学、物理学和有机物理学三篇，分别代表了精神由于自身内部矛盾而从低级向高级发展的三个阶段，并揭示了自然界内部的联系和转化。作为黑格尔《哲学全书》的第二部分，《自然哲学》构成了他用唯心辩证法对当时的自然科学知识所作出的百科全书式的概述。