《东亚同文书院中国调查手稿丛刊 总目 索引 附录（全一册）》总目部分，包括第1-200册目录，对约2000种日志和报告按类编排，对于未著录出版年、调查的班次等重要信息的手稿，详细考辨其调查路线、调查内容等，进而确定其归属的类别和序列；索引部分，包括人名、地名、调查类别等索引，以方便读者使用；附录部分，包括东亚同文书院历届学生名单、调查线路、手稿本与整理本比勘等方面。