书分为两大部分，包括炎症性肠病标准数据集和核心数据集。标准数据集共17大板块，包括患者人口学信息、就诊记录、现病史、既往史、个人史、家族史、体格检查、诊断信息、实验室检查、内镜检查、超声检查、影像学检查、病理及免疫组化、药物治疗、手术治疗、随访、样本库，所列举的数据元按数据元特点列举子模块、数据元名称、值域/数据类型、数据加工类型等内容。核心数据集部分为标准数据集中的一部分，占标准数据集中约四分之一的数据元，是作者归类的标准数据集中的核心内容，展示方式与标准数据集相同。

该书面向全体医务工作者，尤其是研究炎症性肠病和医疗大数据的临床医生及科研工作者。