《精编<神农本草经>药物彩色图本》分三卷，收录药物365种，按照功效分为上、中、下三品。上品120种，主要是一些无毒药，以滋补营养为主，既能祛病，长服又可强身延年；中品120种，一般无毒或有小毒，多数具补养和祛疾双重功效，但不需久服；下品125种，是以祛除病邪为主的药物，多数有毒或药性峻猛，容易克伐人体正气，使用时一般病愈即止，不可过量使用。另外，《本经》依循《内经》提出的君、臣、佐、使的组方原则，将方剂药物以朝中的君臣地位分，表明其主次关系和配伍的法则。
　　《精编<神农本草经>药物彩色图本》对药物性味已有了详尽的描述，指出寒、热、温、凉四气和酸、苦、甘、辛、咸五味是药物的基本性情，可针对疾病的寒、热、湿、燥性质的不同选择用药，寒病选热药，热病选寒药，湿病选温燥之品，燥病须凉润之流，相互配伍，并参考五行生克的关系。人们只有对药物的归经、走势、升降、浮沉都很了解，才能选药组方，配伍用药。