《两岸经济制度性合作与一体化发展研究》首先试图通过对各种国际区域一体化理论的回顾与评述，扬弃与整合各种区域一体化理论的内容和观点，从区域一体化的动因与必要性、条件与可行性、动力与路径、机制与模式等方面，归纳总结出一个可以系统研究区域合作与一体化问题的综合性的理论分析内容框架；进而试图借鉴这一理论分析框架，从区域一体化理论高度与两岸对外政治经济发展战略以及政治关系与经济关系之关系角度，超过单纯经济层面的分析，对两岸经济制度性合作与一体化的动因与必要性、条件与可行性、动力与路径、机制与模式等方面的问题，进行经济、政治、法律、文化等方面的综合性分析和全面、系统、深入的研究，以便较准确地把握两岸经济制度性合作与一体化进程，并为其实践进行理论与方案准备。